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居家管線與儲水設備只要久未清洗，或是水管老化生鏽，水中細菌就會附著生長在內壁，形成一層黃稠黏膩的細菌聚群，稱為「生性的多醣體，可使各類微生物（包括病原體）一層又一層的增生加厚，當生物膜脫落，這些一塊塊的菌群就順著水流出水龍頭，流進居家的鍋碗瓢盆裡。」

生物膜中隱藏多種病原菌與微生物，包括多種致病的腸道細菌，汙染水質後可能引起各式腸胃疾病，有可能造成小朋友腹痛、腹瀉、發燒、頭痛等症狀。除此之外，生物膜中還可能藏有退伍軍人菌、自由型阿米巴原蟲等致病微生物，這些菌落若脫落管壁流入水中，就會成為自來水的汙染源，影響飲用水安全。

自來水在進入蓄水池、水塔前的水質合格率達99%以上，但在2002年環保署委託台大公共衛生研究所的計畫中發現，自來水在經過儲水池水塔儲存後，會有餘氯降低的情形發生，餘氯降低導致殺菌效果不足，因此水中總菌落數會上升。

這些細菌沿著管壁攀附生長，形成細菌薄膜；再加上水管長期使用的老化生鏽，水質汙染問題絕對是消費者所無法想像。為了家人健康著想，民眾應主動採取自我防護措施，如定期清洗水塔、水管，並使用正確的飲用水殺菌方式，以達成有效殺菌的效果。

居家飲用水管線內細菌重重，如果要保護家人健康，最安全的方法就是做好殺菌措施。但國人的居家飲用水殺菌方式普遍不正確，讓安全再蒙上一層陰影。有醫師表示，許多家庭是採用「煮沸法」進行飲用水殺菌，但多半只要水一滾就將爐火轉熄，其實這是種錯誤的方法。因為水中有些細菌、病毒耐溫性較高，因此需持續沸騰10~15分鐘才能真正有效殺菌。

正確的煮沸法可以殺死水中不耐高溫的細菌與病毒，但是無法去除水中顆粒雜質、懸浮物、有機化合物等有害健康的物質。因此建議消費者的居家飲用水處理選擇過濾及殺菌一次搞定的淨水器，才能喝到乾淨衛生的水。